河南省肿瘤病理学重点实验室实行学术委员会监督指导下的主任负责制，各研究室实行主管人员责任制，主管人员的工作应向重点实验室的正、副主任负责。

学术委员会是重点实验室业务管理方面的最高学术权威组织，其组成由肿瘤病理研究方面的国际、国内及校内三方面的学术权威组成。主要作用是确定实验室研究方向、研究课题可行性、科研成果进行鉴定和评定、指导学术活动等。

本实验室现拥有4个现代化研究室，即分子病理研究室、形态定量研究室、细胞生物研究室、临床病理与基因诊断研究室，配套有免疫组化室、信息室、裸鼠室、大型切片室、电镜室和医学影像室等。拥有大批先进的实验设备，包括电子显微镜、高速冷冻离心机、CO2培养箱、凝胶扫描系统、DNA测序/差异显示系统、PCR及原位PCR仪、酶标仪、超纯水制造系统、多媒体图象分析系统等。